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Forest Defenders: Have fun while fighting deforestation

Mar 27th, 2014 | By
Figure 1 First prototype of Forest Defenders running on IPad

Figure 1 First prototype of Forest Defenders running on IPad

Tower defense games like Forest Defenders are a sub-genre of real-time strategy video games. The goal of tower defense games is to try to stop enemies from crossing a map by building traps to slow them down and towers which shoot at them as they pass. Enemies and towers usually have varied abilities, costs, and upgrade prices. When an enemy is defeated, the player earns money or points, which are used to buy or upgrade towers. Choosing the type and positioning of the personal towers is the essential strategy of the game.

A phase of the game is dedicated specifically to the purpose of gathering detections of deforestation from the players. The game is played in two steps. First is the detection phase, during which the player looks for deforested areas by comparing satellite images of the same area taken at different dates. What the player identifies as deforestation is then stored into a server for further analysis.

Figure 2 The game during the deforestation detections phase.

Figure 2 The game during the deforestation detections phase.

The game then randomly selects some of the areas where the player indicated possible deforestation and gives the player a plus or minus depending on if the player’s detections match Terra-i ones. Next the tower defense phase starts and continues until the player either survives all the enemy’s attacks or loses the game.

Figure 3 Forest Defenders was presented during the open house day of the University of Applied Sciences Western Switzerland on March 21st 2014

Figure 3 Forest Defenders was presented during the open house day of the University of Applied Sciences Western Switzerland on March 21st 2014

This first prototype of Forest Defenders is based on MODIS NDVI images with a resolution of 250m. Although it is working smoothly and is fully playable, users have been struggling to interpret the NDVI maps. The next step of development will therefore be to incorporate new satellite imagery datasets such as Landsat 8 as a basemap.

Grégoire Aubert, main developer of this first prototype of Forest Defenders, says “The actual version of Forest Defenders, even without a perfect balancing of its elements and its difficulty, seems to appeal to people. Most of the people who tried it out, liked it. They found it a bit difficult at first and didn’t always understood how to recognize and detect a deforestation. But after few attempts, they wanted to play again and try to beat it.” He continued, “this project was challenging and required a lot of work to achieve the actual result. I acquired a lot of experience in game and mobile application development. And learning all these new things and developing this project was very exciting and interesting.”

You can download an alpha version of the game here and install it by following these instructions.

NOTE: This is only a prototype version which does not represent in any case the final game. This apk has been tested on many devices and has been proven to be stable and safe. However, you install this app at your own risk and we decline any responsibility for the safety of your device if you do so.

Blog post by Louis Reymondin. Revision of English-language version by Caitlin Peterson (CIAT / CCAFS visiting researcher).


Hot out of the oven! Fresh data from CCAFS-Climate

Jan 27th, 2014 | By
The improved CCAFS-Climate data portal includes new data from the IPCC 5th Assessment Report. Image: NASA Goddard Space Flight Center Scientific Visualization Studio.

The improved CCAFS-Climate data portal includes new data from the IPCC 5th Assessment Report. Image: NASA Goddard Space Flight Center Scientific Visualization Studio.

If you were wondering what that delicious smell is coming from the CCAFS kitchen, it’s probably the climate data we just pulled out of the oven.

The CCAFS-Climate data portal recently released downscaled, ready-to-be-used data corresponding to the IPCC’s 5th Assessment Report (AR5). The data include around 25 Global Climate Models (GCMs) for four Representative Concentration Pathways (RCP) and four time periods (2030s, 2050s, 2070s and 2080s).

CCAFS-Climate, created in 2008, houses thousands of gigabytes worth of global datasets for climate change projections that can be used in climate change impact assessments. The difference between these data and, say, those provided by GCMs at raw resolution is that they have been downscaled to make them useful on smaller scales and in countries for which complicated Regional Climate Models are not available.

See more details on the new climate data on the CCAFS blog.

Continued collaboration between AgTrials, CropOntology, AgMIP, CSISA and others

Jan 15th, 2014 | By

beandivcross posted on AgTrials Blog.

The Climate Change and Agricultural Food Security  (CCAFS) program’s AgTrials initiative places a strong emphasis on partnerships with other initiatives,  and on interoperability between systems designed for crop improvement applications.  On the upstream end, linking to information resources is a critical input to making the agricultural trial database work.  Our collaboration with CropOntology –  an international initiative developed by the Generation Challenge Program for standardizing terms  related to crops and crop plant traits — illustrates this approach. Their system gives us standardized terminology,  allowing us to integrate information across a large number of data providers all over the world. On the downstream end, the AgTrials resource is available to any group that needs this kind of information in applied research. One good example is the Agricultural Modeling Inter-comparison and Improvement Project (AgMIP). AgTrials and AgMIP have already been working to integrate their systems. Expect much more to come in 2014. AgTrials is developing another area of collaboration with the Cereal Systems Initiative for South Asia (CSISA). As an example of how these collaborations work, see below a presentation on the CropOntology initiative made at the Plant and Animal Genomics conference in San Diego, USA.


1st International e-Conference on Germplasm Data Interoperability

Dec 20th, 2013 | By

AgTrials hold information on nearly 35,000 trials across the world.

Cross-posted on AgTrials Blog

Today the AgTrials project ( participated in the 1st International
e-Conference on Germplasm Data Interoperability. The meeting was all about linking germplasm data between different applications with the goal of supporting research and development related to plant science and crop improvement. The discussion and the presentations focused on strategies for data interoperability, visions of linked germplasm data, data providers perspectives on current status and use of data and metadata for germplasm, infrastructures for germplasm data, and standards and metadata. Check out the website for the E conference. It was an innovative way to do an online conference (at least for me, as I had never used Google Hangout). All of the presentations are available and the discussion was recorded on YouTube. People that are interested in some of the different developments related to bio-informatics, plants and crop germplasm and biodiversity information can find some of the latest developments by major players in this field.

The AgTrials presentation focused on efforts to link bio informatics systems and our experience with metadata. AgTrials has a critical link with the CropOntology initiatives of the Generation Challenge Program and Bioversity. Metadata on traits and variables measured during an evaluation trial are standardized according to the CropOntology protocol. AgTrials is also making dynamic connections to the Agricultural Modeling Inter-comparison and Improvement Project (AgMIP). these links are made by mapping variables and metadata between systems and by developing application programming interfaces that allow the system to talk to each other. More work is needed on linking is the cultivars that are tested to gene bank and genomic information. Realizing the potential of crop improvement will require much more integration to link genotype to phenotype. In 2014, the AgTrials initiative is committed to linking our efforts to other groups that are part of the bio informatics ecosystem.

Metadata for the Global Evaluation Trial Repository of CCAFS and interoperability with germplasm data from Decision and Policy Analysis Program


Terra-i gana primer lugar del Premio GeoSUR 2013

Nov 26th, 2013 | By
Por: Andrea Carvajal, Comunicaciones CIAT

El equipo de investigadores de Terra-i, liderado por Louis Reymondin, tiene nuevas razones para celebrar, pues el viernes 22 de noviembre, en Montevideo, Uruguay, recibió el Premio GeoSUR 2013 en el marco del Sexto Encuentro del Programa GeoSUR, La Red Geoespacial de América Latina y el Caribe. A la premiación asistieron alrededor de 50 personas, entre directivos y representantes de los centros de información cartográfica de los 21 países de América Latina.

De izquierda a derecha: Eric van Praag, coordinador regional de Programa GeoSUR; Rigoberto Magaña, presidente del IPGH; Claudia Ulloa, cooperación técnica del IPGH; Alejandro Coca, miembro del equipo Terra-i; y Santiago Borrero, secretario general del IPGH.

De izquierda a derecha: Eric van Praag, coordinador regional de Programa GeoSUR; Rigoberto Magaña, presidente del IPGH; Claudia Ulloa, cooperación técnica del IPGH; Alejandro Coca, miembro del equipo Terra-i; y Santiago Borrero, secretario general del IPGH.

GeoSUR es una red coordinada por el Banco de Desarrollo de América Latina y el Instituto Panamericano de Geografía e Historia (IPGH). La misma que ha reconocido en Terra-i una iniciativa que contribuye al desarrollo de la gestión geoespacial para múltiples finalidades y para los diferentes países de la región latinoamericana. Terra-i es un sistema de monitoreo de la deforestación en casi tiempo real para América Latina, que detecta los cambios de la cobertura del suelo resultantes de las actividades humanas, el cual utiliza las imágenes satelitales de este continente capturadas cada 16 días. Las salidas de datos de la herramienta se registran en un sitio web interactivo, de acceso abierto y gratuito que permite al usuario investigar y monitorear el cambio de uso del suelo en toda América Latina y el Caribe. Actualmente se está trabajando para ampliar el cubrimiento hacia todo el trópico.

Alejandro Coca es el investigador del CIAT que representó al equipo de Terra-i en la entrega del premio que consta de un diploma de reconocimiento y la suma de 2000 dólares.

Alejandro aprovechó la ocasión para agradecer, en su breve discurso de aceptación del premio, el apoyo recibido por parte de donantes como The Nature Conservancy (TNC); la constante colaboración de la Universidad de Ciencias Aplicadas y Artes de Suiza Occidental (HES-SO) y King’s College de Londres; el esfuerzo y dedicación puesto por profesionales, estudiantes en práctica y tesistas del Área de Investigación en Análisis de Políticas (DAPA) del CIAT; y el interés demostrado por los usuarios y la comunidad en general. Todos ellos actores claves para hacer de Terra-i una herramienta útil para la mejor toma de decisiones en un tema crucial como la deforestación y pérdida de los hábitats naturales de América Latina.


Post original:




Datos climáticos: ¡Ahora en línea!

Nov 25th, 2013 | By

Elaborado por: Diego Alzate y Patricia Moreno

Post original en página Convenio MADR

Se inició una fase muy importante para cumplir con el propósito de masificar la generación de información agrometeorológica y hacerla de fácil acceso a los aliados del proyecto. Desde el 12 de noviembre arrancó el envío en tiempo real de los datos que están siendo tomados en cada una de las parcelas experimentales y zonas de estudio del Convenio con el MADR. Esta información hace parte de un insumo necesario en los diferentes modelos de cultivo evaluados dentro del marco del proyecto.

De esta forma, fueron instalados los módulos de Internet a las estaciones meteorológicas del proyecto para que su información este disponible en tiempo real.  Desde ahora podremos  realizar la consulta y descarga de los datos  de cada una de las estaciones registradas en el sistema de manera gratuita en cualquier momento.



Figura 1. Visualización de la plataforma de Weaather Underground.

Aprovechando el incremento en la cobertura de los operadores celulares en el país en los últimos años y las facilidades tecnológicas actuales como la existencia de servidores climáticos internacionales gratuitos, se programaron las estaciones para el envío de datos al servidor  Weather Underground, que es actualmente el servidor más robusto y con mayores servicios en el mundo (Figura 1). Ocho (8) estaciones del convenio MADR-CIAT han sido conectadas a este servidor y desde ya se pueden consultar sus datos en tiempo real.

El montaje de los aparatos y módulos de internet requirió contar con cobertura de internet celular y energía eléctrica en la zona de instalación de la estación (Ver Figura 2).

Situaciones como cortes de energía eléctrica o intermitencia en la señal celular pueden generar interrupciones en el envío de los datos climáticos. Es así como la instalación de las estaciones meteorológicas de bajo costo al igual que el internet hace parte de una fase de prueba y aprendizaje de parte de todos los actores inmersos en el proyecto.

Estación Cereté Instalación en Chinú (Córdoba)
Figura 2. Montaje de la consola, módem y router de la estación de Cereté (izq.) y Chinú (der.) en el departamento de Córdoba.

En los próximos días esperamos poner en línea la totalidad de las estaciones meteorológicas del convenio y continuar así avanzando en el proceso de masificación de la información climatológica como parte de una estrategia de reducción de la vulnerabilidad a los efectos de la variabilidad climática en el sector agrícola colombiano.

Para mayor información acerca de alguna de las estaciones y los datos, visitar los siguientes links acorde a la estación de su interés:

Weather Underground PWS IATLNTIC2 Weather Underground PWS ICRDOBAM3 Weather Underground PWS ICRDOBAC12 Weather Underground PWS ICRDOBAS5

Un homenaje a Jorge Humberto Becerra y su aporte a la base de datos climáticos

Nov 20th, 2013 | By

Yo creo que aunque la gente no lo ve, la lucha para construir la base de datos de clima ha sido continua. En la época en que empecé no había programas para este trabajo y después de dos años habíamos recolectado datos de más o menos 5000 estaciones en América Latina y seguían llegando datos a diario (Pjones 2004).

Jorge Humberto Becerra   junto con el Dr. Peter Jones y Yuviza  en los años 80, fueron los primeros integrantes del grupo “Unidad de Estudios Agroecológicos” hoy programa DAPA en CIAT.   Humberto, fue el economista  responsable  de almacenar los datos diarios de las principales variables atmosféricas  de casi 20.000 estaciones metereológicas para los países tropicales  que hoy  hacen parte de las base de datos climáticos  y al uso de la tecnología conocida como Big Data que sirven a la comunidad científica y benefician  directamente a nuestros  agricultores.

Su pérdida repentina nos ha conmovido a quienes tuvimos la oportunidad de conocerle como profesional, compañero de trabajo y padre ejemplar con sus hijas.  Recordado por su gran interés en la lectura y en especial su pasión por el periodista y caricaturista Antonio Caballero,  con quien se identificaba con sus ideas políticas y sociales revolucionarias.  Siempre guardaba sus notas y en algunos casos hasta sus palabras.

Pero hoy no podemos perder esta oportunidad de agradecer su valioso  aporte a las base de datos climáticas.  Nunca olvidaremos quienes generaron estos datos  con los que hoy continuamos investigando sobre modelos de predicción para una esperanza mejor.

Es aquí  y ahora cuando la realidad nos está demostrando “como los datos nos están conectando”.  Una iniciativa de los 80 con datos climáticos nos unió, un Big DATA social como facebook nos reencontró para despedirnos.

Participación del grupo de BIG DATA de DAPA en la XXXIV Reunión del Comité Administrativo del FLAR, realizada el 4 y 5 de noviembre en San José, Costa Rica.

Nov 15th, 2013 | By

La semana pasada Daniel Jiménez del grupo de BIG DATA de DAPA participó en la  XXXIV Reunión del Comité Administrativo del FLAR, realizada el 4 y 5 de noviembre en San José, Costa Rica.

XXXIV Reunión del Comité Administrativo del FLAR

XXXIV Reunión del Comité Administrativo del FLAR


Edgar Torres líder del programa  de arroz y Eduardo Graterol director del FLAR brindaron la oportunidad a Daniel de hacer una presentación acerca del Uso de grandes datos (Big Data) en la Agricultura- Caso de estudio FEDEARROZ en Colombia

Presentación de Daniel Jiménez en el congreso

Presentación de Daniel Jiménez

Durante su intervención Daniel compartió los resultados de la investigación obtenidos con su equipo en el tema de agricultura específica por sitio que lidera en el marco del convenio MADR-CIAT en cambio climático.

Precisamente el tema que lidera está orientado hacia la estrategia de adaptación que investiga cuáles son los factores que conducen a altas o bajas productividades en cada sitio productivo, con el fin de apoyar a  los gremios y sus productores con cultivos más resistentes ante la variabilidad climática.

Gracias a que FEDEARROZ a través de la subgerencia técnica y de investigaciones económicas  ha compartido información  de la Encuesta Nacional Arrocera (ENA) , información meteorológica y registros de cosecha con el grupo de DAPA;  a través de la presentación se ilustró la influencia del clima y del manejo agronómico a la variación del rendimiento. Se evidenció como a través de análisis multivariados  lineales y no lineales se puede obtener información acerca de: (a) como las variedades responden de manera diferente a los diferentes patrones climáticos; (b) la disminución de rendimientos en ciertos periodos, (c) la influencia del clima y el manejo agronómico en el rendimiento del cultivo en cada sitio productivo.

Particularmente llamó la atención de los investigadores y de la audiencia como el equipo, trabajando en conjunto con el programa de arroz y su fisióloga Camila Rebolledo, ha logrado explicar solo con variables de clima más del 40% de la variabilidad en rendimiento de arroz en la estación experimental de Saldaña. Lo anterior a través de un análisis que considera las etapas fenológicas en lugar de todo el periodo. Otro de los hallazgos del equipo fue encontrar que valores de energía solar acumulada en fase de llenado de grano por encima de 19 000 cal/cm^2  podrían representar una diferencia de producción de alrededor de una Tonelada por hectárea.

Modelo explicativo climático para el rendimiento en arroz

Modelo explicativo climático para el rendimiento en arroz

Con dichos resultados el gremio arrocero podría trabajar con los productores el tema de fechas de siembra buscando hacer coincidir el llenado de grano con los óptimos de radiación y así mejorar la producción y mitigar los impactos del cambio climático.  Adicionalmente los hallazgos han generado el interés particular del grupo de arroz de CIAT, pues este tipo de metodologías y resultados en la medida que se repliquen en otros sitios se convierten en un insumo importante para el área de mejoramiento genético del cultivo.

 Al final de la charla Daniel hizo énfasis en que lo expuesto era el caso del gremio arrocero en Colombia pero que las herramientas, recurso humano, tecnológico, voluntad y pasión por el tema están al servicio de toda la región; invitando así a los demás socios del FLAR en Latinoamérica  a participar en ejercicios similares que les ayuden a prepararse mejor al cambio climático y optimizar sus sistemas de producción.


Pedometrics conference 2013: Spatial and temporal modeling of soil

Sep 6th, 2013 | By

DAPA africa team member Kennedy Ng’ang’a attended the 10th biennial meeting of Pedometricians happened in Nairobi, Kenya between 26th  – 31st August 2013. The gathering attracted participants from around the world with various institutes and organizations being represented. The Pedometrics Conference 2013 was held at the ICRAF campus and was jointly hosted by CIAT and ICRAF.


This year’s meeting was divided into two parts; a pre-conference workshop and the main conference. The 2-day pre-conference workshop exposed participants to the latest approaches in modeling and mapping soil properties. Both geostatistical approaches as well as machine-learning approaches to mapping soil were presented and practiced. The hands-on approach of the workshop allowed many participants to explore these techniques and have a greater appreciation of how they are implemented.

The main conference attracted over 65 participants drawn from 15 countries. Keynote addresses were delivered by senior scientists including the Director General of ICRAF, the Director of Soils Research Area at CIAT, The Principal Scientist at the Kenya Agricultural Research Institute, as well as the Chair of Division 1.5 of the International Union of Soil Science. Presentations at the conference touched on diverse topics ranging from Digital Soil Mapping, Pedotransfer Functions, Advances in Proximal and Remote Sensing, as well as Analytical Techniques for Assessing Soil Organic Carbon stocks.


In addition, there was also a poster presentation as well as a field trip to north-central Kenya where participants practically engaged in soil classification using different classification systems. The field trip also provided participants with a chance to interact with locals and observe the conservation approaches being practiced by pastoralist communities in the region. An additional bonus was the wide range of wildlife which was seen by participants as they went about the field trip. All this contributed to a highly educational and entertaining experience both during the pre-conference, the actual conference and the field trip. In summary Pedometrics 2013 was a huge success!


The Terra-i tool presented as conservation asset at world’s largest GIS conference

Aug 5th, 2013 | By

Terra-i team member Alejandro Coca familiarized attendees of the the world’s largest Geographic Information Systems (GIS) and conservation event in California, U.S.A., with the goals and prospects of Terra-i. The 33rd ESRI User Conference and 16th Annual Conference of the Society for Conservation GIS (SCGIS) were held recently in July, both conferences forming part of a global scholarship program for which the SCGIS awarded Alejandro a competitive month-long sponsorship.

The GIS and conservation community showed strong interest in the project’s approach, the consistency of its data, and its open-source philosophy for data delivery.

Figure 1. As part of the SCGIS scholar program, Alejandro presented Terra-i’s work during the ESRI and SCGIS international conferences in California, USA.

Figure 1. As part of the SCGIS scholar program, Alejandro presented Terra-i’s work during the ESRI and SCGIS international conferences in California, USA.

In addition to the Terra-i conference sessions, Alejandro and staff from the International Food Policy Research Institute (IFPRI) joined in activities at the CGIAR Consortium for Spatial Information (CGIAR-CSI) booth, located in the Environmental Showcase section of the ESRI conference. Along with Terra-i, web-GIS applications such as HarvestChoice and RTBMaps were highlighted and introduced to conference-goers.

This year CGIAR received its first award from ESRI for the development of the RTB web application.

The SCGIS scholarship program also awarded Alejandro with three ESRI instructor-led training courses related to topics such as performing GIS analysis, improving cartography as well as publishing maps based on ESRI services to the web.

Figure 2. Multi-national scholars are supported every year to attend the ESRI and SCGIS conference and present their conservation projects.

Figure 2. Multi-national scholars are supported every year to attend the ESRI and SCGIS conference and present their conservation projects.

The Terra-i project acknowledges The Society for Conservation GIS and ESRI for supporting Alejandro’s attendance at these world-recognized events.